Merge pull request #1026 from DavidKarlas/cacheThreadInfo

[Mono.Debugger.Soft] Adding caching of ThreadInfo in ThreadMirror

[mono-api-html] Refactor to ensure the RegEx (if used) is applied everywhere

* The existing regex was not always used (e.g. new sections);

* It's now possible to use a regex on 'removed' (not just added) elements;

* It's possible to use the same regex for both (or have different ones);

[counters] Fix operator precedence

[counters] Edit dump_counter to use mono_counters_sample and accessors

[gsharedvt] Add tests for large structs.

Initialize out parameters to NULL.

Fixes a crash in the debugger, where we were freeing random pointers:

(lldb)
frame #2: 0x000dc981 monotouchtest`method_commands_internal(command=<unavailable>, method=<unavailable>, domain=<unavailable>, p=0x7f52aca4, end=<unavailable>, buf=<unavailable>) + 9009 at debugger-agent.c:8116
   8113 g_free (il_offsets);
   8114 g_free (line_numbers);
   8115 g_free (column_numbers);
-> 8116 g_free (end_line_numbers);
   8117 g_free (end_column_numbers);
   8118 g_free (source_files);
   8119 g_ptr_array_free (source_file_list, TRUE);

[Mono.Debugger.Soft] Adding caching of ThreadInfo in ThreadMirror

[corlib] Use invariant culture for GetTempFileName generator

[xbuild] Don't crash when reporting top level unknown elements

[System.Core] Fix MOBILE-implementation of MemoryMappedFile

Internal API was updated only for the non-MOBILE part. Public/shared API requires them in sync.

[counters] Fix -1 array access in case counter is of type string and value is null

[counters] Improve the documentation of the counters API.

[counters] Fix the build and do some error handling.

Merge pull request #1022 from ludovic-henry/pr9-string-counters

[counters] Add support for string values

[counters] Fix potential overflow in string sampling

[mono-api-html] Prettier output when dealing with arrays ([] or [][]), nullable (?) and pointers (*).

Merge pull request #1023 from LogosBible/NetworkStreamBeginWriteInnerException

Include inner exception when BeginWrite fails due to exception from Sock...

[counters] Add support for string values

Add new function mono_counters_register_with_size which let the counters API now what is going to be the max size of the string.
The type of the value passed when MONO_COUNTER_STRING is passed must be char* (instead of char** previously). This is to guarantee that, if we want to change the value of the counter, we do not reallocate and free the old value, but we change the value in place. Thus to avoir race condition and access to freed memory.

Include inner exception when BeginWrite fails due to exception from Socket.BeginSend.

Undo project change from 073fe7a39cd9d64d77bc9687c50fd49bb0c66fdd which should not be included

Fix the check in 4660f44381e6f686b0cf3ded08564104c277e00a for special files.

[mcs] Fix completion for `new {' input

[mcs] Don't report interface implementation errors for optional implementations. Fixes #18030

Fix the build.

[system.core] Fix some MemoryMappedFile argument checks

[sdb] Add end lines/end columns to line number information.

Add end line/end column information to the mdb file format and pdb2mdb.

[corlib] Rethrow user not initialization exception when lazy initialization throws. Fixes #19564

Fix copyright.

[mono-api-html] Allow a lax processing mode of the XML files

This is useful when the files needs to be pre-processed (e.g. a major change between the assemblies internals) and where some duplicate entries might be created (e.g. merged types/namespaces).

Note: normally the mono-api* tools should not produce such files (so it's better not used unless required)

[mono-api-html] Prettier output using singular and plural forms in sections

[counters] Fix --stat to not dump counters for all sections.

Merge pull request #1018 from ermshiperete/xamarin-19567

[MWF] Clear currentCell before disposing (fixes #19567)

[sgen-bridge] Add color duplication  pathology.

[sgen] Improve bridge comparison code a bit.

[sgen-bridge] Add the tarjan-coloring bridge.

The tarjan-coloring bridge is significant departure from the old bridge. It's design is based
on the Tarjan Strongly Connected Component algorithm.

SCC links are calculated as part of the Tarjan dfs on the second scan to calculate the low index and
form the components.

The algorithm does inspect all children after they have been processed, which enables us to do backward
propagation of the reachable SCCs.

In order to avoid the xref mess of the old algorithm, we color each component based on the sum of all
reachable components (colors). This means no matter how many non-bridge objects are in between two bridges,
they will all receive the same color and be represented in the final output as a single node in the SCC
graph.

This allows for a reasonably compact output graph as it will only include colors with no bridges when
a single object has multiple bridges reachable.

Said that, the basic algorithm received a series of optimizations:

1)Flag based merging, great idea from Mark, it bounds color and xref merging to be linear on the number of
colors found.

2)Objects and Colors bucket allocation. Instead of using expansible arrays we use fixed size buckets that
form a linked list. This allow us to use direct pointers instead of indexes. It avoid the expensive expansions.
Another benefit is that it reduces the work by sgen's malloc, which can be really slow.

3)Replace the object hash table with header patching. We tag objects with both pinning and forwarded bits and
store a pointer in the lock word. This eliminates the hashtable, a big source of perf issues. Patching objects
back at the end of bridge processing is much much cheaper than free'ing all the hashtable entries.

4)Color deduplication. It's possible to produce duplicated colors due to mutually unreachable paths that
both points to the same set of bridges. A cache is introduced to reduce it for colors points to 2 or 3 others.

The way we build colors allow us in the future to fix the hub object problem (SetupDoubleFan).

Experimental results with sgen-bridge-pathologies shows this implementation been 2-3x faster than the new one.

[bridge] change the log entry name to make it easier to read logs.

[sgen-bridge] Each bridge needs it own internal mem type as their sizes differ.

Merge pull request #1010 from davidmoore1/bug-19304

Prevent call to OwnerLostFocusHandler for disposed object

[mcs] Include more unicode categories in parsing identifier part character. Fixes #18229

[MWF] Clear currentCell before disposing (fixes #19567)

If currentCell still has a value when we call Columns.Clear() we
might try to end the editing. Because the columns got disposed
before calling Columns.Clear() we get a crash. This patch fixes
the problem by setting currentCell to null.

[MWF] Unit test for DataGridView bug (#19567)

Merge pull request #992 from ludovic-henry/ludovic-counters-pr1

[counters] Add sample and accessors to mono counters API

[mcs] Emit null constant value for default parameters of generic types to indicate not missing value. Fixes #19033

[mcs] Report error for invalid unary nullable predefined operators

[mcs] Do type parameter conversion involving type parameters using dependency rules. Fixes #18473

Merge pull request #1017 from akoeplinger/fix-monocc

[Mono.CodeContracts] Always build debug file for the test assembly

[Mono.CodeContracts] Always build debug file for the test assembly

The tests require that the debug file is available, however in the net_4_0 profile this file isn't generated by default.
We now ensure the debug file is always generated for the test assembly.

[mono-api-html] Prettier output of ref and out (instead of &)

[mono-api-html] Make the [Obsolete] a bit prettier when no text message is available

[sdb] Add a new TypeMirror.NewInstance () method which can create valuetypes without a ctor.

[Mono.Debugger.Soft] Modified TypeMirror.NewInstance() to check that the method is a .ctor

[mono-api-html] Report [Obsolete] members in a separate section (not as both removed and added with an [Obsolete]). That makes it easier to read long API diff reports

[counters] Disable register filter on valid_mask

This was previously used to not store counters that were not going to be dumped, but because we can now sample them, we have to make sure that they are stored, even if we do not plan to dump or sample them.

[dlr] Emit correct code for convert of nullable types. Fixes #19500

[counters] Fix type issue on mini counters

Used MONO_COUNTER_WORD for gint32 variable, crashed on 64bits platform.

[counters] Use macro to copy counter in sampling, and use sizeof directly instead of mono_counter_get_size

The use of sizeof will enable compilers optimization on memcpy.

[mcs] Emit all method like members in same order as they appear in source code. Fixes #19509

[counters] Sample should fail if buffer size is too small

[counters] Add sample and accessors functions

[mcs] Convert extended underlying enum constants to their underlying type. Fixes #18866

[corlib] Remove stale comments

System: Fix the previous bulid

[System] Fix build warnings

[jit] Register the Mono_UnhandledException_internal icall when TARGET_ANDROID is set.

[runtime] Fix some automake conditionals in scripts/, they should be in the beginning of the line.

[runtime] Fix a warning which happens because we store the thread tid as a guint64.

[sgen-bridge] Don't forward a node to itself.

[sgen-bridge] Compare xrefs between bridge implementations, too.

[sgen-bridge] Compare SCCs between bridge implementations.

[sgen-bridge] Allow second bridge implementation to run alongside the active one.

[sgen-bridge] Small refactoring.

[sgen-bridge] Move bridge debug option handling to sgen-bridge.c.

[sgen-bridge] Set bridge_processing_in_progress in sgen-bridge.c.

[sgen-bridge] Also separate old bridge into pre- and post-callback.

[sgen-bridge] Move processing of API data structures to sgen-bridge.c, for sgen-new-bridge.c.

[sgen-bridge] Separate before- and after-callback in new bridge.

[sgen-bridge] Special-case ptr array for 1 entry without allocating.

[sgen-bridge] Use bit field for is_visited and finishing_time.

[sgen-bridge] Make finishing_time a 32 bit unsigned int.

[sgen-bridge] Fix forwarding.
We can't forward to HashEntry's because they are volatile - the
hash table will resize, and the entries move.  We need to point to
the objects, and then look them up via the hash.  Also, we have
to forward chains of forwards.

[sgen-bridge] Remove redundant object pointer in hash table entry.

[sgen-bridge] Separate DFS1 and DFS2 fields in HashEntry.

[sgen-bridge] Add a new bridge (non-)pathology.

[sgen-bridge] object_is_live() should be called object_needs_expansion().

[sgen-bridge] Debugging option to dump whole bridge object graph.

[sgen-bridge] Remove single-reference non-bridge objects from graph.

[sgen-bridge] Added test case with bridge performance pathologies.

This is not meant as part of the test suite, but as a reference for
where the bridge has performance issues.

[sgen-bridge] Copy-on-write for DynArrays.

This eliminates a pathological case for the old algorithm, where a
large array of SCCs is copied from one node to the next without
modification.

[sgen-bridge] Remove dead DynArray merging code.

[sgen] Heavy hash table statistics.

[sgen-bridge] Make merging in old xrefs algorithm much more efficient.

Instead of merging the two lists by keeping them sorted, use the flag on
the SCCs the indicate whether an SCC has already been merged in, and
just append it if not.  This makes it as fast as the new algorithm on one
test case where it was pathologically slow, while not exhibiting another
pathology that the new algorithm has.

[sgen-bridge] New xrefs graph optimization for nodes with incoming order 1.

[sgen-bridge] Don't merge xrefs in DFS2. Speeds up some cases by orders of magnitude.

Support the datetime2 parameter type

[Mono.Debugger.Soft] Fixed the ILInterpreter to catch ArgumentExceptions from ObjectMirror.GetValue()

[Mono.Debugger.Soft] Make the ObjectMirror.GetValues() exception a bit more useful

[mcs] Don't apply reference type is optimization for dynamic expressions. Fixes #19423

Merge pull request #1013 from ranma42/fix-19380

Fix 19380

[mcs] Inflate anonymymous method with correct type arguments when async this requires hoisting in parent type. Fixes #19176