[io-layer] Precise memcpy of handle structs.
First issue found by AddressSanitizer.

[MS.Build] cleanup ITaskItem evaluation related old code.

[MS.Build] now ITaskItems are collected while evaluating expression and metadata is filled later.

It is kind of reverting previous implementation of item metadata for expression.
Code cleanup should follow.

[MS.Build] skip null string entry as input to string.Join().

[msbuild] ongoing ITaskItem input parameter handling improvements.

Right now all the input parameters are computed based on string, and any
metadata items are simply chopped out when it is passed to a Task.
To fix this, we need to replace ExpandString() use with more complicated
evaluator that takes ITaskItem into consideration.

(It is not complete as of now; evaluation method needs to be replaced and
any regressions need to be fixed.)

[MS.Build] more of the same (remove obsolete comment).

[MS.Build] remove extraneous expression evaluation code.

[MS.Build] add another expression expansion test.

[MS.Build] output item was dropping metadata after running task.

[mprof-report] Add counter filter when not in verbose mode

This will reduce the amount of printed counters in non verbose mode.

[mprof-report] Extract the counter key prefix of dump_counters_value

[runtime] Avoid calling mono_thread_current () in sgen_thread_detach (), since it can construct objects. Fixes #19755.

[mdoc] Fix NullReferenceException when importing @name attribute.

(Reported by directhex on #mono 2014-05-14 at 14:28 EDT.)

When importing Microsoft XML Documentation, if a //altmember/@name,
//exception/@name, or //permission/@name attribute is encountered then
mdoc will die with a NullReferenceException:

mdoc: System.NullReferenceException: Object reference not set to an instance of an object
  at Mono.Documentation.MsxdocDocumentationImporter.ImportDocumentation (Mono.Documentation.DocsNodeInfo info)
  at Mono.Documentation.MDocUpdater.MakeDocNode (Mono.Documentation.DocsNodeInfo info)
  at Mono.Documentation.MDocUpdater.UpdateMember (Mono.Documentation.DocsNodeInfo info)
  at Mono.Documentation.MDocUpdater.MakeMember (System.Xml.XmlDocument doc, Mono.Documentation.DocsNodeInfo info)
  at Mono.Documentation.MDocUpdater.DoUpdateType2 (System.String message, System.Xml.XmlDocument basefile, Mono.Cecil.TypeDefinition type, System.String output, Boolean insertSince)
  at Mono.Documentation.MDocUpdater.StubType (Mono.Cecil.TypeDefinition type, System.String output)
  at Mono.Documentation.MDocUpdater.DoUpdateType (Mono.Cecil.TypeDefinition type, System.String basepath, System.String dest)
  at Mono.Documentation.MDocUpdater.DoUpdateAssembly (Mono.Cecil.AssemblyDefinition assembly, System.Xml.XmlElement index_types, System.String source, System.String dest, System.Collections.Generic.HashSet`1 goodfiles)
  at Mono.Documentation.MDocUpdater.DoUpdateAssemblies (System.String source, System.String dest)
  at Mono.Documentation.MDocUpdater.Run (IEnumerable`1 args)
  at Mono.Documentation.MDoc.Run (System.String[] args)
  at Mono.Documentation.MDoc.Main (System.String[] args)

The cause of the NullReferenceException is due to inconsistent
checking: we check that _either_ `child.Attributes["cref"]` OR
`child.Attributes["name"]` is not null, and if one of them IS non-null
then we just grab `child.Attributes["cref"].Value`, which will throw a
NullReferenceException if the @name attribute was present but not the
@cref attribute.

The fix is to be consistent: once we grab an XmlAttribute, use the
already looked up XmlAttribute, don't re-look it up.

[runtime] Avoid passing commands to lldb using the python api, it doesn't seem to work well in script files. Fixes #19732.

[xbuild] Fix parsing messages with empty/blank origin

[runtime] Fix Process.TotalProcessorTime becoming negative. Fixes #19739.

[system.net.http] Set version to 4.0.0.0 on MOBILE

For a variety of reasons, we need to bump the assembly version of
System.Net.Http.dll to "4.0.0.0" (from 2.0.5.0) on our MOBILE
profiles, lest much pain and suffering occur, e.g.:

http://motzcod.es/post/78863496592/portable-class-libraries-httpclient-so-happy

> For some reason at compile time the facades don’t kick in
> properly and it tries to use the NuGet version of
> System.Net.Http which has some specific functionality for
> older platforms. ...
> All you need to do is create a new app.config file in your
> Android and iOS project.

The need to create a custom app.config is ugly and something
to be avoided. Setting our System.Net.Http.dll version to
v4.0.0.0 removes the need for the custom app.config.

Merge pull request #1037 from DavidKarlas/fixingParamName

Fixing regression from previous commit

[Mono.Debugger.Soft] Fixing regression from previous commit where type name instead of parameter name was used

Merge pull request #1036 from DavidKarlas/cacheSdbLocking

[Mono.Debugger.Soft] Adding thread locking on access to tokensCache dictionary

[Mono.Debugger.Soft] Adding thread locking on access to tokensCache dictionary

Merge pull request #1035 from DavidKarlas/cacheSdb

[Mono.Debugger.Soft] More caching

[runtime] Fix a pair of thread abort races in classic abort code.

The two races in question are:

In signal_thread_state_change we need to block the target from
further waiting before we signal it or otherwise it might miss the
broadcast asking it to wakeup.

In mono_thread_request_interruption we need to ensure we self interrupt
before returning from the signal handler.

[jit] Unblock more critical signals at startup.

Unblock the GC suspend/restart signals and SIGCHLD. Those are required to make the GC
and process watching work.

The SIGCHLD issue was found on mod_mono that fork a process with that signal blocked.

The GC signals are been preemptively unblocked as we can never know what sort of sig mask
we'll start with.

[gc] Add mono_gc_get_restart_signal.

[sgen] Implement mono_gc_get_restart_signal.

[boehm] Implement mono_gc_get_restart_signal.

[System.IO.KeventWatcher] Introduce enums with the KEvent flags and constants

This merely introduces a more readable version of some of the constants that
were hardcoded on the source code.

There is a suspect value "20" that was on the original source code, that
stands for VNodeLink and VNodeExtend, but perhaps the original author
meant to say VNodeRename.   In any case, it seems like we should catch all
of them (except for Revoke).

[bcl] Fix Process.PrivateMemorySize64 on osx, we now return task_baic_info.resident_size. Fixes #19738.

Clean up the usage of FILETIME structures, avoid accessing them as gint64 since that would lead to alignment problems. Hopefully fixes #19739.

[Mono.Debugger.Soft] Caching tokens resolving

[Mono.Debugger.Soft] Using cached GetParameters when fetching GetLocals

[mprof-report] Fix crash in case no counters values were sampled because of too short run time

[sdb] Avoid stack overflows when a boxed vtype recursively references itself using fields. Fixes #18914.

[profiler] Add managed backtrace support to sampling mode for the signal-based impl.

[mprof-report] Fix bug where no counters would be printed if --verbose or --counters-sort=category were not passed

[profiler] Filter more event types in mprof-report based on time (more xambug #11904).

[profiler] In mprof-report fix handling of the time filter when starting from 0 (xambug #11904).

[profiler] Emit statistical samples at 1 second intervals and fix race condition.

Merge pull request #1020 from ludovic-henry/pr7-system-counters

[counters] Add system counters

[counters] Edit according to Kumpera review

[system.web] remove some more remnants of Mono.Web.dll to fix Xamarin Studio activation

The section mapping system wasn't being initialized and used properly since some ifdefs had
been left in the source code. This caused a null reference exception while trying to perform
some HTTP requests and, as the result, broke Xamarin Studio activation.

[arm] Add support for the new compare instructions used by native types.

[decode] Edit according to Paolo review

[decode] Fix sample difference parsing

[decode] Add command line counters options parsing

[decode] Add dump_counters

Two main way to dump :
 - per Time : equivalent to a --stats but every seconds, useful to see the overall evolution of all counters
 - per Category : print sample values grouped per category and counters, useful to see the evolution of a specific counter over time

[decode] Add parsing for TYPE_SAMPLE_COUNTERS

[decode] Add parsing for TYPE_SAMPLE_COUNTERS_DESC

[decode] Add functions to transform mono-counters enum to strings

[decode] Add functions to manipulate counters, counters_sections and counters_timestamps

This variables are respectively :
 - the list of all counters
 - the list of all counters grouped by sections
 - the list of all counters groupes by sample value timestamps and sections

[decode] Add Counter, CounterValue, CounterList, CounterSection and CounterTimestamp structs

Counter : contains metadata concerning a counter. There is one in memory per counter index (right now ~100).
CounterValue : represent a sample value of a counter.
CounterList : it is a utility struct that contains a list of counters.
CounterSection : represent all the counters that are in this sections. Used only when we sort counters per category.
CounterTimestamp : represent all the counters that have a sample value at this timestamp. Used only when we sort counters per time.

[decode] Add check for computer endianness on startup

[http] Convert string output data using BOM header when available. Fixes #19667

[system.net.http] Fix encoding of Content-MD5. Based on patch by nberardi. Fixes #19644

[sdb] Fix a deadlock in the assembly cache invalidation code.

[sdb] Avoid placing implicit sequence points at offsets where the IL stack is empty when using symbol file based sequence points. Fixes #13640.

[jit] Add a test for lrem_un.

[sdb] Fix the serialization of variables with address mode VTADDR.

[eglib] Remove test-glib code, we don't have to maintain compatibility with glib any more. Fixes #19638.

[xbuild] Make tool output parsing more robust

It's now also much more compatible with the subtleties of
the MS .NET parser and includes a substantial test suite.

Fixes BXC19542 - Broken F# Error Reports

[runtime] Remove an assert from inner_start_thread () on win32 which is not needed.

[tests] Fix a trivial consistency issue in a test case.

[xbuild] Implement WriteCodeFragment task

[xbuild] Add ItemDefinitionGroup basic handling

[xbuild] Evaluate Choose and PropertyGroup elements in order of appearance

[xbuild] Simplify and speedup ConditionFunctionExpression

Remove last traces of Mono.Web

Merge pull request #1028 from DavidKarlas/sdbTypesCaching

[Mono.Debugger.Soft] Caching Assemblies and Types

assign project FullPath before creating ProjectInstance so that properties are assigned appropriately.

MSBuildExtensionsPath32/64 should default to MSBuildExtensionsPath value.

fix previous change (huh, I was blind, no such option -f, use -p).

use mkdir -f to ignore "directory already exists" error.

Merge pull request #1029 from ranma42/dont_free_global_codeman-cleanup

[runtime] Remove the last bits of mono_dont_free_global_codeman

[mono-api-html] Add the [Obsolete] message for API additions and removals

Less common case - unless the API difference has a large delta.

Some additional spacing is added to ease readability: if an entry takes two line then it needs a empty line.

[runtime] Remove the last bits of mono_dont_free_global_codeman

All uses of the mono_dont_free_global_codeman variable (including its
definition) have been removed in
4a1ae4694a2d4fc06bd1cb02b88dfeeeb8c90630.

Its declaration should be removed as well to keep the codebase clean.

[runtime] Wait for the finalizer thread to exit in both code paths where waiting for it succeeded.

Fix make runtest-managed in tests/.

Fix make check in tests/

[Mono.Debugger.Soft] Catching AssemblyMirror in AppDomainMirror and TypeMirror in AssemblyMirror

[runtime] Remove the mono_dont_free_global_codeman hack, it shouldn't be needed now that we actually wait for threads to exit.

[jit] Disable the interval based linear scan algorithm in aot+debug mode, since it doesn't respect cfg->disable_reuse_registers, leading to problems during debugging when registers are shared between variables.

[Mono.Debugger.Soft] Added TypeMirror.IsNested

Merge pull request #1024 from ludovic-henry/pr10-proflog-counters

[proflog] Add counters support to proflog

[proflog] Edit according to Paolo review

Update MONO_CPU_ARCH description in man/mono.1.

Merge Mono.Web back into System.Web and remove the Mono.Web module

Merge pull request #1026 from DavidKarlas/cacheThreadInfo

[Mono.Debugger.Soft] Adding caching of ThreadInfo in ThreadMirror

[mono-api-html] Refactor to ensure the RegEx (if used) is applied everywhere

* The existing regex was not always used (e.g. new sections);

* It's now possible to use a regex on 'removed' (not just added) elements;

* It's possible to use the same regex for both (or have different ones);

[counters] Fix operator precedence

[counters] Edit dump_counter to use mono_counters_sample and accessors

[gsharedvt] Add tests for large structs.

Initialize out parameters to NULL.

Fixes a crash in the debugger, where we were freeing random pointers:

(lldb)
frame #2: 0x000dc981 monotouchtest`method_commands_internal(command=<unavailable>, method=<unavailable>, domain=<unavailable>, p=0x7f52aca4, end=<unavailable>, buf=<unavailable>) + 9009 at debugger-agent.c:8116
   8113 g_free (il_offsets);
   8114 g_free (line_numbers);
   8115 g_free (column_numbers);
-> 8116 g_free (end_line_numbers);
   8117 g_free (end_column_numbers);
   8118 g_free (source_files);
   8119 g_ptr_array_free (source_file_list, TRUE);

[Mono.Debugger.Soft] Adding caching of ThreadInfo in ThreadMirror

[corlib] Use invariant culture for GetTempFileName generator

[xbuild] Don't crash when reporting top level unknown elements

[System.Core] Fix MOBILE-implementation of MemoryMappedFile

Internal API was updated only for the non-MOBILE part. Public/shared API requires them in sync.

[counters] Fix -1 array access in case counter is of type string and value is null

[counters] Improve the documentation of the counters API.

[counters] Fix the build and do some error handling.